Uporaba bioinformatskih pristopov v medicini

Vsebina: 
1. Predavanja, seminarsko delo in konzultacije: 
Spoznavanje spletnih orodij, podatkovnih zbirk in programov, ki omogočajo določitev kritičnih genov, vpletenih v kompleksne bolezni. Načrtovanje raziskav za odkrivanje kandidatnih genov pri izbranih boleznih, uporaba spletnih orodij in podatkovnih zbirk, bioinformatsko določanje celičnih poti in interakcij izbranih genov, in silico določanje funkcijskih učinkov genetskih variabilnosti v kodirajočih področjih v genih, in silico funkcijska analiza polimorfizmov v regulatornih in promotorskih regijah. Spoznavanje pristopov za izbiro in validacijo bio-označevalcev.

2.DOŠ: Bioinformatični eksperimentalni pristopi pri raziskovanju rakavih bolezni. Študenti bodo spoznali raziskovalne pristope pri preučevanju molekularne genetike raka. S pomočjo spletnih orodij bodo določili primerne kandidatne gene, ki bi lahko bili povezani z razvojem raka, in pretehtali možne eksperimentalne pristope za ugotavljanje sprememb v izbranih genih. V nadaljevanju bodo postopoma izbrali primerne polimorfizme v izbranih genih, jih ovrednotili s pomočjo spletnih orodij in določili frekvence genotipov v populacijah. Hkrati bodo z in silico metodami poskušali ovrednotiti tudi funkcijske učinke kodirajočih, regulatornih ali promotorskih polimorfizmov.  


Cilji in kompetence:
Cilj predmeta je seznaniti poslušalce z osnovami raziskav v molekularni biologiji kompleksnih bolezni, ki vodijo do prenosa metod v diagnostične laboratorije, s poudarkom na rakavih obolenjih. Študenti bodo pridobili znanje o načrtovanju poskusov pri raziskavah raka in iskanju novih kandidatnih genov. Naučili se bodo uporabljati osnovna spletna orodja in podatkovne zbirke. Spoznali bodo bioinformatske osnove, ki jih uporabljamo v moderni genetiki in jih znali interpretirati. Študenti bodo aktivno sodelovali pri pouku z iskanjem kandidatnih polimorfizmov pri izbrani modelni bolezni. Študenti se bodo seznanili tudi z in silico eksperimentalnimi pristopi, ki omogočajo ugotavljanje vpliva genetske variabilnosti na funkcijo proteinov. 
 


NAJAVA


REŽIM ŠTUDIJA

(REŽIM ŠTUDIJA)


URNIK

(URNIK)


OBVESTILA O PREDMETU


DRUGE INFORMACIJE O PREDMETU

Ime in priimek
T: +386 1 543 77 20
E: ime.priimek(at)mf.uni-lj.si

Ime in priimek
T: +386 1 543 77 20
E: ime.priimek(at)mf.uni-lj.si

Informacije

Ime in priimek
T: +386 1 543 77 20
E: ime.priimek(at)mf.uni-lj.si

uradne ure